১৯৯০ সালের মে মাসে দক্ষিণ ও উত্তর ইয়েমেন ঐক্য হওয়ার পর সালেহ প্রেসিডেন্ট কমিশনের চেয়ারম্যানের দায়িত্ব পালন করনে। ১৯৯৩ সালের অক্টোবর মাসে তিনি পুনরায় চেয়াম্যান নির্বাচিত হন। ১৯৯৪ সালের সেপ্টেম্বর মাসে ইয়েমেন প্রেসিডেন্ট কমিশন বাতিল করে অক্টোবর মাসে সালেহ প্রেসিডেন্ট নির্বাচিত হন। সালেহ ১৯৯৭ সালের ডিসেম্বর মাসে তিনি মার্শালের মর্যাদা লাভ করেন। ১৯৯৯ সালের সেপ্টেম্বর মাসে তিনি ইয়েমেন ঐক্যবদ্ধ হওয়ার পর নির্বাচনে প্রথমে প্রেসিডেন্ট নির্বাচিত হন। ২০০৬ সালের সেপ্টেম্বর মাসে তিনি পুনরায় প্রেসিডেন্ট নির্বাচিত হন। ২৭ সেপ্টেস্বর তিনি শপথ গ্রহণ করেন। ইয়েমান প্রেসিডেন্টের মেয়াদ সাত বছর।

    সালেহ ১৯৮৭ সালের ডিসেম্বর, ১৯৯৮ সালের ফেব্রুয়ারী ও ২০০৬ সালের এপ্রিল মাসে তিনবার চীন সফর করেন।